Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPON2Q9BUD6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms