Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms