Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERPUD2Q9BSE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms