Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms