Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GINS3Q9BRX5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms