Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAAF1Q9BRP4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms