Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM2D3Q9BRN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms