Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3AQ99856 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3AQ99856 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms