Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP8Q99708 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms