Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGREF1Q99674 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms