Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOTCH4Q99466 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOTCH4Q99466 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTCH4Q99466 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms