Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN18Q96SJ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms