Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UIMC1Q96RL1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms