Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK15Q96Q40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms