Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCEEQ96PE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms