Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00052Q96N35 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00052Q96N35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms