Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC7Q96M83 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC7Q96M83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CCDC7Q96M83 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC7Q96M83 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC7Q96M83 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms