Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf72Q96LT7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf72Q96LT7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms