Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOLD1Q96LR9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOLD1Q96LR9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOLD1Q96LR9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.6 ms