Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT74Q96LB3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT74Q96LB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms