Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED3Q96IU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms