Protein–RNA interactions for Protein: Q96I34

PPP1R16A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R16AQ96I34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R16AQ96I34 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R16AQ96I34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R16AQ96I34 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms