Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH4

TMEM169, Transmembrane protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM169Q96HH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM169Q96HH4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM169Q96HH4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM169Q96HH4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms