Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SFRP2Q96HF1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms