Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms