Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms