Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTP4Q96DX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms