Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC58Q96CX6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC58Q96CX6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms