Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1AQ96CP6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms