Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GCC1Q96CN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms