Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf44Q96CB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf44Q96CB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf44Q96CB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf44Q96CB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms