Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms