Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MARVELD3Q96A59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MARVELD3Q96A59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms