Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYAP1Q96A49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms