Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF34Q969K3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms