Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN3Q969G5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN3Q969G5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms