Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKD2Q969F2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms