Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFFLQ8WZ73 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFFLQ8WZ73 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFFLQ8WZ73 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFFLQ8WZ73 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFFLQ8WZ73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms