Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms