Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG1Q8WVM7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG1Q8WVM7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms