Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD4Q8WVF5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms