Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
AGR3Q8TD06 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms