Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM71BQ8TC56 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM71BQ8TC56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM71BQ8TC56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms