Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf43Q8TAL5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms