Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A4Q8NFF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms