Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APCDD1LQ8NCL9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APCDD1LQ8NCL9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms