Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIML1Q8N9V2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIML1Q8N9V2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms