Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Y2

ATP6V0D2, V-type proton ATPase subunit d 2, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D2Q8N8Y2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V0D2Q8N8Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V0D2Q8N8Y2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D2Q8N8Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms