Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms