Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms